Wissenschaftliche:r Angestellte:r Junior / Doktorand:in (all genders) Computational Pediatric Oncology - Forschungsinstitut Kinderkrebs-Zentrum

Am Forschungsinstitut Kinderkrebs-Zentrum am Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf ist in der Arbeitsgruppe Computational Pediatric Oncology (Leitung Prof. Dr. Michael Bockmayr) zum 01.11.2026 eine Stelle als wissenschaftliche:r Mitarbeiter:in (PhD-Student) zu besetzen. Ein späterer Eintritt ist prinzipiell denkbar. Eine Promotion ist möglich und wird aktiv unterstützt.

Die Stelle ist im Rahmen eines BMFTR-geförderten Juniorverbundprojekts zu besetzen, das in enger Kooperation mit der TU Berlin (Dr. Mina Jamshidi Idaji/Machine Learning Group) und der LMU München (Prof. Dr. Philipp Jurmeister/Computational and Molecular Pathology) durchgeführt wird. Im Mittelpunkt steht die Entwicklung neuartiger Methoden für das multimodale maschinelle Lernen in der computergestützten Diagnostik. Ziel ist die Integration histopathologischer, klinischer und molekularer Daten zur Optimierung KI-gestützter Entscheidungshilfen in der Onkologie.

Eine professionelle und individuelle Betreuung wird über den gesamten Zeitraum gewährleistet. Darüber hinaus erwartet Sie im Forschungsinstitut ein motiviertes und dynamisches Team aus Ärzt:innen, Naturwissenschaftler:innen, Bioinformatiker:innen, technischen Assistent:innen und Studierenden, die im Rahmen unterschiedlicher Projekte und Ansätze der Erforschung kindlicher Krebserkrankungen auf der Spur sind.

Ihre Aufgaben:

• Entwicklung und Evaluierung klinisch relevanter multimodaler Klassifikationsalgorithmen mit Methoden des maschinellen Lernens auf Basis von Bilddaten und hochdimensionalen Omics-Datensätzen
• Integration von histologischen, molekularen (Genomik, Epigenomik, Transkriptomik auf Bulk- und Einzelzellebene) und klinischen Daten
• Enge Zusammenarbeit mit den Kooperationspartner:innen und weiteren Forschungsgruppen am Kinderkrebszentrum
• Präsentation der Forschungsergebnisse auf internationalen Konferenzen und Veröffentlichung als Erstautor:in in anerkannten Fachzeitschriften

Die Position ist drittmittel- und projektbedingt auf drei Jahre befristet.

• Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium im Bereich Maschinelles Lernen, Bioinformatik, Informatik, Data Science, Angewandte Mathematik, Physik, Biomedical Engineering oder einem anderen relevanten Studiengang
• Nachgewiesene Programmiererfahrung in Python, gute Kenntnisse von ML-Frameworks wie PyTorch oder TensorFlow. Programmierkenntnisse in R sind vorteilhaft.
• Fundierte Kenntnisse aktueller Methoden des maschinellen Lernens
• Ausgezeichnete Kommunikationsfähigkeit und Fähigkeit zur interdisziplinären Zusammenarbeit
• Sichere Englischkenntnisse in Wort und Schrift, Deutschkenntnisse sind vorteilhaft
• Vorerfahrungen mit Representation-Learning, Transformer-Architekturen und erklärbarer KI (xAI) sind vorteilhaft
• Kenntnisse zur Verarbeitung von Omics-Daten und grundlegenden Methoden der Molekularbiologie sind vorteilhaft, aber nicht erforderlich. Für uns zählen vor allem Ihre fundierten Programmier- und ML-Kenntnisse
• Kenntnisse im Umgang mit UNIX-basierten Betriebssystemen und Versionskontrollsoftware sind wünschenswert

Wir freuen uns auf eine aussagekräftige Bewerbung inkl. Motivationsschreiben, CV, Referenzen, Abschlusszeugnissen, Liste der besuchten Lehrveranstaltungen sowie ggf. Verlinkung von Code-Beispielen, Abschlussarbeiten oder Publikationen.

• Faire und transparente Vergütung nach unserem Tarifvertrag TVöD/VKA (63.600 € - 91.100 €) unter Berücksichtigung von Qualifikationen und Berufs­erfahrung. Die Gehaltsangabe bezieht sich auf eine Vollzeitstelle mit 38,5 Wochenstunden. Die genannten Beträge sind Richtwerte und stellen kein Gehaltsversprechen dar.
• Gezielte und individuelle Weiterentwicklung auf Fach- und Projektebene ist gegeben, so bieten wir eine langfristige Perspektive in einem sinnstiftenden Umfeld
• Umfangreiche Fort- und Weiterbildungspro­gram­me an unserer UKE-Akademie für Bildung und Karriere
• Möglichkeiten zur Mitgestaltung unserer Per­sonalpolitik „UKE INside“ in berufsgruppen- und hierarchieübergreifenden Projekten
• Nachhaltig unterwegs: Zuschüsse zum Deutsch­landticket als Jobticket und Dr. Bike Fahrrad­service
• Ausgezeichnete Gesundheits-, Präventions- und Sportangebote
• Familienfreundliches Arbeitsumfeld: Kooperation zur Kinderbetreuung, kostenlose Ferienbetreu­ung, Beratung für Beschäftigte mit pflegebe­dür­ftigen Angehörigen
• Krisensicherer Arbeitsplatz, sinnstiftende Tätig­keit, wertschätzendes Miteinander
• Strukturierte Einarbeitung und offener Wissens­austausch im Team
• Unser Mitarbeitenden Restaurant bietet eine reiche Auswahl an kulinarischen Angeboten; weitere Angebote gibt es in den „Health Kitchen“ Cafés und Bistros und in einem Supermarkt direkt auf dem Gelände

Wir leben Diversität und schätzen Vielfalt

Wir bieten ein Arbeitsumfeld, das unabhängig von Alter, Geschlecht, sexueller Identität, Behinderung, ethnischer und sozialer Herkunft oder Religion gleiche Chancen ermöglicht. Dieses bestätigen wir mit dem Beitritt zur Charta der Vielfalt. Wir streben ausdrücklich eine Erhöhung des Anteils von Frauen in Führungspositionen an, insbesondere beim wissenschaftlichen Personal in Forschung und Lehre. Gleiches gilt im Falle einer Unterrepräsentation eines Geschlechts im ausschreibenden Bereich. Personen mit Schwerbehinderung werden bei gleicher Eignung, Befähigung und fachlicher Leistung vorrangig berücksichtigt.

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