Data Scientist / Biostatistiker:in / Wissenschaftliche:r Angestellte:r (all genders) - AF-B-STEP

Am Universitären Herz- und Gefäßzentrum (UHZ) des Universitätsklinikums Hamburg-Eppendorf (UKE) denken wir klinische und translationale kardiovaskuläre Forschung direkt integriert in unsere tägliche Patient:innenversorgung. Unser Ökosystem verbindet umfassend phänotypisierte Kohortenstudien mit 10.000+ Teilnehmer:innen einschließlich Biobanking, struktierten Nachuntersuchungen und insbesondere neue patient:innenzentrierte Methode, u. a. durch vernetzte Smart Health Devices, wie Wearables. Wir leiten und beteiligen uns an internationalen, Leitlinien-prägrendenden klinischen Studien.

AF-B-STEP ist ein seit 2026 gefördertes EU-IHI-Konsortium, welches durch unser Zentrum koordiniert wird. Wir untersuchen, wie mit Hilfe moderner kontinuierlicher und intermittierender Monitoring-Tools Diagnose, Risikostratifizierung und Behandlung von Vohorfflimmern optimiert und individualisiert werden kann. Vorhofflimmern ist die häufigste Herzrhythmusstörung, führt zu Herzschwäche und Schlaganfällen und mehr als ein Drittel der über 55-jährigen sind erkrankt. Die Ergebnisse des Konsortiums werden eine hohe Relevanz für kardiologische Leitlinien und möglicherweise regulatorische Entscheidungen der FDA und der EMA haben. Das Konsortium vereint 18 Partner aus Wissenschaft, Industrie und Patient:innenorganisationen in ganz Europa und Kanada und integriert Daten aus über 60 klinischen Studien und von 500.000 Patient:innen. Mehr unter afburden.org.

Ihre Rolle: Sie entwerfen und betreiben die Dateninfrastruktur des Konsortiums und leiten Analysen in einem der größten harmonisierten kardiovaskulären Datensätze: AF-BOLD soll Daten zur Vorhofflimmernlast und Outcomes aus über 60 klinischen Studien mit mehr als 200.000 Patient:innenjahren Follow-Up integrieren. Sie entwerfen und implementieren Pipelines für die Harmonisierung, Qualitätssicherung und KI-gestützte Anomalieerkennung. Die Daten stammen aus strukturierten Datensätzen, Remote-Patient-Monitoring Plattformen implantierten Herzschrittmachern und Defibrillatoren, digitalen EKGs, Bildgebung, Timeseries Daten aus Wearables, sowie Abrechnungsdaten von Krankenversicherungen. Sie koordinieren das zentrale Data-Science-Team des Konsortiums, wirken an der Betreuung von Nachwuchswissenschaftler:innen mit und entwickeln moderne Strategien zum Metadatenmanagement mit semantischer Anreicherung (SNOMED CT, LOINC) und KI-gestützter Extraktion aus klinischen Dokumenten. Sie arbeiten direkt mit Wissenschaftler:innen in führenden akademischen Einrichtungen und bei Industriepartnern zusammen, und sind an Veröffentlichungen beteiligt, die sowohl für klinische Leitlinien als auch für regulatorische Entscheidungen von Aufsichtsbehörden relevant sein können. Damit gestalten Sie Forschung, die Behandlungsentscheidungen weltweit beeinflussen wird.

Es handelt sich um eine Stelle mit befristeter Laufzeit von zunächst drei Jahren (Drittmittelprojekt). Eine Verlängerung wird angestrebt.

• Master oder Promotion in Data Science, (Bio)Informatik, (Bio)Statistik, oder einem eng verwandten quantitativen Fachgebiet
• Mindestens zwei Jahre Berufserfahrung nach Abschluss des Studiums, die durch Ihren Lebenslauf belegt wird – Nebenjobs während des Studiums und Praktika werden nicht
• Technische Exzellenz in Data Science und Data Engineering, nachgewiesen durch eine GitHub-Präsenz, publizierte Paper, oder ein vergleichbares Projektportfolio
• Sicherer Umgang mit PyTorch, sowie praktische Erfahrung in der Entwicklung moderner Microservice- und API-basierter Software, sowie Einhaltung von Qualitätsstandards
• Erfahrung mit relationalen Datenbanken (z. B. PostgreSQL), Objektspeichern (z. B. MinIO), Versionskontrolle einschließlich CI/CD mit Git und GitLab
• Echte Neugierde für die klinische kardiovaskuläre Medizin, intrinsische Motivation, Ergebnis-orientiertes Arbeiten, sowie ausgeprägte Fähigkeiten im Selbstmanagement, die Sie im Anschreiben und Vorstellungsgespräch darlegen und begründen können
• Intrinsischer Wunsch, die Translation wissenschaftlicher Ergebnisse in die Patient:innenversorgung zu treiben
• Hervorragende Kommunikationsfähigkeiten in Deutsch und Englisch; Fähigkeit zwischen technischen und klinischen Partnern zu kommunizieren und Nachwuchswissenschaftler zu betreuen

Wünschenswert

• Erfahrung in der Analyse prospektiver bzw. randomisierter klinischer Studiendaten, idealweise im kardiovaskulären Bereich
• Erfahrung mit Datenstandards für klinische Studien (z. B. CDISC SDTM/ADaM) und/oder medizinischen Ontologien (SNOMED CT, LOINC)
• Nachweisbare praktische Kenntnisse in der Anwendung und Entwicklung NLP- und/oder LLM-basierter Methoden zur Informationsextraktion aus medizinischen Texten
• Nachweisbare praktische Erfahrung in der Administration von Linux-basierten Forschungsinfrastrukturen, Kubernetes für Microservice-Architekturen und Workload-Automatisierung

Bitte bewerben Sie sich mit Ihrem Lebenslauf, einem Motivationsschreiben, in dem Sie Ihre Forschungsinteressen im Projekt sowohl aus technischer als auch aus klinischer Perspektive darlegen, Referenzprojekten, die Ihre fachliche Kompetenz belegen, sowie einer Beschreibung Ihres eigenen Beitrags zu diesen Projekten, und den Kontaktdaten von vorzugsweise drei Forschern, die sich bereit erklärt haben, Referenzschreiben zu verfassen.

• Attraktive Bezahlung nach TVöD/VKA
• Krisensicherer Arbeitsplatz, sinnstiftende Tätigkeit, wertschätzendes Miteinander
• Strukturierte Einarbeitung und offener Wissensaustausch im Team
• Umfangreiche Fort- und Weiterbildungsprogramme an unserer UKE-Akademie für Bildung und Karriere
• Möglichkeiten zur Mitgestaltung unserer Personalpolitik „UKE INside“ in berufsgruppen- und hierarchieübergreifenden Projekten
• Nachhaltig unterwegs: Zuschüsse zum Deutschlandticket als Jobticket und Dr. Bike Fahrradservice
• Familienfreundliches Arbeitsumfeld: Kooperation zur Kinderbetreuung, kostenlose Ferienbetreuung, Beratung für Beschäftigte mit pflegebedürftigen Angehörigen
• Ausgezeichnete Gesundheits-, Präventions- und Sportangebote
• Unser Mitarbeitendenrestaurant bietet eine reiche Auswahl an kulinarischen Angeboten; weitere Angebote gibt es in den „Health Kitchen“ Cafés und Bistros und in einem Supermarkt direkt auf dem Gelände

Wir leben Diversität und schätzen Vielfalt

Wir bieten ein Arbeitsumfeld, das unabhängig von Alter, Geschlecht, sexueller Identität, Behinderung, ethnischer und sozialer Herkunft oder Religion gleiche Chancen ermöglicht. Dieses bestätigen wir mit dem Beitritt zur Charta der Vielfalt. Wir streben ausdrücklich eine Erhöhung des Anteils von Frauen in Führungspositionen an, insbesondere beim wissenschaftlichen Personal in Forschung und Lehre. Gleiches gilt im Falle einer Unterrepräsentation eines Geschlechts im ausschreibenden Bereich. Personen mit Schwerbehinderung werden bei gleicher Eignung, Befähigung und fachlicher Leistung vorrangig berücksichtigt.

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