Wissenschaftliche:r Mitarbeiter:in (all genders) für den Bereich Bioinformatik – Metagenomik/Virusgenomik

Einsatzbereich: Die Position ist in dem DFG-Sonderforschungsbereich (SFB) 1648 „Neu auftretende Viren: Pathogenese, Struktur, Immunität“ integriert, der sich mit neu auftretenden Virusinfektionen und ihrer Bedeutung für die globale Gesundheit auseinandersetzt. Das neu gegründete CRC 1648 zielt darauf ab, ein tiefes Verständnis der Virus-Wirt-Interaktionen, der Struktur, der Pathophysiologie und der Immunität gegen bestimmte neu auftretende Virusinfektionen zu erlangen. Für das Teilprojekt - Metagenomik in neu auftretenden Virusinfektionen - wird eine Mitarbeit mit ausgewiesener bioinformatischer Expertise gesucht. Das Projekt befasst sich mit dem Pathogennachweis in Sequenzdaten, mit der Integration von Pathogen-und Wirtstranskriptomdaten zur verbesserten Vorhersage von Infektionskrankheiten. Das Teilprojekt wird in der Arbeitsgruppe von Frau Prof. Dr. Nicole Fischer lokalisiert sein.

Ihren Aufgaben:

• Analyse und Interpretation von Next-Generation-Sequencing (NGS)-Daten und anderen molekularbiologischen Datensätzen
• Bearbeitung von Forschungsprojekten zur Entwicklung von Metagenomik Software Platformen in der Infektionsdiagnostik
• Entwicklung, Implementierung und Validierung von Bioinformatik-Pipelines zur Verarbeitung und Visualisierung großer Datenmengen
• Automatisierung von Workflows und Datenverarbeitungsprozessen zur Steigerung der Effizienz
• Etablierung aktueller NGS basierter Biomarker in der Routinediagnostik

Diese Position ist im Rahmen des Sonderforschungsprojektes vorerst bis zum 30.06.2028 befristet. Eine Verlängerung ist avisiert.

• Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium der Bioinformatik oder eines verwandten Studienfaches
• Verhandlungssichere Deutschkenntnisse und gute Englischkenntnisse
• Kenntnisse in den Bereichen Sequenzanalyse, Virusgenomik, Skriptsprachen
• Fundierte Kenntnisse in der Analyse von NGS Daten und anderen molekularen Technologien
• Kenntnisse in der Anwendung und Entwicklung von Bioinformatik-Software sowie von Datenbanken (z. B. Ensembl, COSMIC, dbSNP)
• Solide Linuxkenntnisse
• Interesse an Virologie, Mikrobiologie und molekularer Diagnostik
• Engagement, Koordinations- und Organisationsgeschick, schnelle Auffassungsgabe, Selbständigkeit, Teamfähigkeit und sehr gute Kommunikationsfähigkeit

• Attraktive Bezahlung nach TVöD/VKA
• Krisensicherer Arbeitsplatz, sinnstiftende Tätigkeit, wertschätzendes Miteinander
• Strukturierte Einarbeitung und offener Wissensaustausch im Team
• Umfangreiche Fort- und Weiterbildungsprogramme an unserer UKE-Akademie für Bildung und Karriere
• Möglichkeiten zur Mitgestaltung unserer Personalpolitik „UKE INside“ in berufsgruppen- und hierarchieübergreifenden Projekten
• Nachhaltig unterwegs: Zuschüsse zum Deutschlandticket als Jobticket und Dr. Bike Fahrradservice
• Familienfreundliches Arbeitsumfeld: Kooperation zur Kinderbetreuung, kostenlose Ferienbetreuung, Beratung für Beschäftigte mit pflegebedürftigen Angehörigen
• Ausgezeichnete Gesundheits-, Präventions- und Sportangebote
• Unser Mitarbeitendenrestaurant bietet eine reiche Auswahl an kulinarischen Angeboten; weitere Angebote gibt es in den „Health Kitchen“ Cafés und Bistros und in einem Supermarkt direkt auf dem Gelände

Wir leben Diversität und schätzen Vielfalt

Wir bieten ein Arbeitsumfeld, das unabhängig von Alter, Geschlecht, sexueller Identität, Behinderung, ethnischer und sozialer Herkunft oder Religion gleiche Chancen ermöglicht. Dieses bestätigen wir mit dem Beitritt zur Charta der Vielfalt. Wir streben ausdrücklich eine Erhöhung des Anteils von Frauen in Führungspositionen an, insbesondere beim wissenschaftlichen Personal in Forschung und Lehre. Gleiches gilt im Falle einer Unterrepräsentation eines Geschlechts im ausschreibenden Bereich. Personen mit Schwerbehinderung werden bei gleicher Eignung, Befähigung und fachlicher Leistung vorrangig berücksichtigt.

> Hier mehr zum Thema „Diversity im UKE“ erfahren.